Deteksi White Spot Syndrome virus (WSSV) pada Udang Vannamei (Litopenaeus vannamei) menggunakan metode Quantitative PCR (qPCR) Di PT Windu Alam Sentosa Rembang

Karya Praktik Ilmiah ini membahas deteksi White Spot Syndrome Virus (WSSV) pada udang vannamei (Litopenaeus vannamei) menggunakan metode Quantitative Polymerase Chain Reaction (qPCR) di PT Windu Alam Sentosa (WAS), Rembang. WSSV merupakan salah satu penyakit virus yang paling berbahaya dalam budidaya udang karena dapat menyebabkan kematian massal dalam waktu singkat dan menimbulkan kerugian ekonomi yang besar bagi pembudidaya. Oleh karena itu, diperlukan metode deteksi yang cepat, sensitif, dan akurat untuk mengetahui keberadaan virus sejak dini. Tujuan dari kegiatan praktik ini adalah untuk mengetahui hasil deteksi WSSV pada udang vannamei menggunakan qPCR, mengidentifikasi gejala klinis udang yang terinfeksi, serta memahami kondisi manajemen budidaya dan lingkungan yang berkaitan dengan kesehatan udang.
Kegiatan praktik dilaksanakan di PT Windu Alam Sentosa Rembang pada tanggal 10 Maret sampai 1 Juni 2026 dengan metode survei dan magang. Pengumpulan data dilakukan melalui observasi, wawancara, dokumentasi, dan kuesioner. Sampel yang digunakan berupa air kolam dan udang vannamei yang kemudian diuji menggunakan metode qPCR melalui tahapan ekstraksi DNA dan amplifikasi DNA untuk mendeteksi keberadaan WSSV. PT Windu Alam Sentosa merupakan perusahaan hatchery udang vannamei yang memiliki kapasitas produksi sekitar 60 juta post larva per bulan dan menerapkan sistem biosecurity, pengolahan air (water treatment), serta pengawasan kualitas melalui laboratorium quality control guna menjaga mutu benur yang dihasilkan.
Hasil pengujian menunjukkan bahwa pada DOC 34 dan DOC 47 sampel air maupun udang dari kolam A5 dan A6 masih menunjukkan hasil negatif terhadap WSSV. Infeksi pertama kali terdeteksi pada kolam A5 saat DOC 57 dengan nilai Ct sebesar 29,05 yang termasuk kategori infeksi ringan. Selanjutnya pada DOC 59, kolam A6 terdeteksi positif WSSV dengan nilai Ct sebesar 14,05 yang menunjukkan infeksi berat karena jumlah partikel virus yang lebih tinggi dibandingkan kolam A5. Hasil tersebut menunjukkan bahwa infeksi WSSV dapat berkembang dengan cepat dan penting dilakukan pemantauan kesehatan secara rutin menggunakan qPCR agar infeksi dapat dideteksi sejak fase awal sebelum menyebabkan kerugian yang lebih besar. Udang yang terinfeksi WSSV menunjukkan beberapa gejala klinis khas, antara lain munculnya bintik-bintik putih pada karapas, perubahan warna tubuh menjadi kemerahan, penurunan nafsu makan, gerakan yang lambat dan lemah, antena yang rusak, serta perilaku berenang yang tidak normal seperti bergerombol di pinggir kolam atau berenang di permukaan air. Gejala-gejala tersebut sesuai dengan karakteristik infeksi WSSV yang menyerang jaringan tubuh udang dan mengganggu proses fisiologis serta metabolisme normal.
Selama masa pemeliharaan, pertumbuhan udang pada kedua kolam masih tergolong baik. Nilai Average Body Weight (ABW) dan Average Daily Growth (ADG) terus mengalami peningkatan hingga DOC 56. Pada akhir pemeliharaan, kolam A5 menghasilkan biomassa panen sebesar 2.692,4 kg dengan ukuran panen 114 ekor/kg, nilai Survival Rate (SR) 82,6%, dan Feed Conversion Ratio (FCR) 1,26. Sementara itu, kolam A6 menghasilkan biomassa sebesar 2.413,2 kg dengan ukuran panen 120,5 ekor/kg, nilai SR 68,7%, dan FCR 1,40. Hasil tersebut menunjukkan bahwa performa budidaya pada kolam A5 lebih baik dibandingkan kolam A6. Rendahnya nilai SR dan tingginya nilai FCR pada kolam A6 diduga berkaitan dengan tingkat infeksi WSSV yang lebih berat sehingga memengaruhi kesehatan udang, efisiensi pemanfaatan pakan, dan hasil produksi.
Berdasarkan hasil kegiatan praktik, dapat disimpulkan bahwa metode qPCR mampu mendeteksi infeksi WSSV secara cepat dan akurat pada udang vannamei. Infeksi WSSV pada kolam A5 tergolong ringan, sedangkan pada kolam A6 tergolong berat berdasarkan nilai Ct yang diperoleh. Meskipun infeksi terdeteksi menjelang akhir masa pemeliharaan sehingga belum memberikan dampak nyata terhadap pertumbuhan, keberadaan virus tetap berpengaruh terhadap tingkat kelangsungan hidup udang dan produktivitas budidaya. Oleh karena itu, diperlukan pengujian kesehatan secara rutin menggunakan qPCR, penerapan biosecurity yang ketat, pengelolaan kualitas air yang baik, serta pengawasan manajemen pakan dan lingkungan untuk mencegah penyebaran WSSV dan meningkatkan keberhasilan budidaya udang vannamei.